Después de unirse a la OTAN en marzo de 2004, Eslovaquia se convirtió en parte del entonces Sistema Integrado de Defensa Aérea de la OTAN en 2006. Desde entonces, la Fuerza Aérea Eslovaca ha estado firmemente integrada con sus aviones de combate MiG-29 en la duradera misión de vigilancia aérea de la Alianza.
Como uno de los tres aliados sin litoral en el norte de Europa, Eslovaquia es uno de los miembros más jóvenes del Sistema Integrado de Defensa Aérea y de Misiles de la OTAN; en el momento de la adhesión de Eslovaquia, todavía se llamaba Sistema Integrado de Defensa Aérea de la OTAN.
Tras los preparativos y el entrenamiento minuciosos de los pilotos, ingenieros y controladores de tráfico aéreo eslovacos para el servicio de Alerta de Reacción Rápida de la OTAN, el avión de combate MiG-29 en la Base Aérea de Zvolen y los controladores aéreos en CRC Zvolen se integraron en el Centro de Operaciones Aéreas Combinadas de Uedem, Alemania.
Los aviones de combate MiG-29 de la Fuerza Aérea Eslovaca se codifican principalmente para interceptar aviones civiles, por ejemplo, cuando los pilotos pierden las comunicaciones por radio con el Control de tráfico aéreo civil o declaran emergencias.
Antes de unirse a la OTAN, los pilotos de la Fuerza Aérea Eslovaca volaron salidas de alerta de reacción rápida en la serie MiG de aviones de combate junto con sus colegas de la Fuerza Aérea Checa sobre el antiguo estado de Checoslovaquia.
OTAN/Marzo 1 de 2021